Shinichi Kudō est le protagoniste de l'histoire, une adolescente de 17 ans devenue un garçon de 6/7 ans après avoir pris un médicament appelé APTX 4869: Conan Edogawa. Il a choisi ce nom des auteurs Sir Arthur Conan Doyle et Rampo Edogawa. Ses parents sont l'écrivain Yusaku Kudo et l'actrice Yukiko Kudo. Il est amoureux de Ran et vit maintenant chez lui avec son père, le détective raté Kogoro Mouri. Avec sa nouvelle identité, il fréquente une école primaire - où il se lie d'amitié avec Ayumi, Genta et Mitsushiko. Après un certain temps, une nouvelle fille arrive à l'école avec le nom d'Haibara Ai qui faisait partie de l'organisation des hommes en noir ( nom de code Sherry) mais un événement qui l’ennuyait l’a amenée à prendre le même médicament que Shinichi, ce qui l’a fait rétrécir. Elle vit maintenant avec le professeur Agasa et fait également partie de la ligue des jeunes détectives qui résolvent des cas avec l’aide de Conan. - et ainsi Shinichi vit son quotidien en essayant de découvrir comment récupérer son vieux corps. Mais alors que les affaires commencent à appeler la maison de Kogoro, Conan cherche d’autres indices lui permettant d’avoir une longueur d’avance sur les «hommes en noir» et, grâce aux inventions du professeur Agasa, il peut facilement résoudre ces affaires en faisant suspecter quiconque, Une des inventions est le changement de nœud papillon et l’horloge avec les pinces anesthésiantes les plus utilisées de la série.
Kogorō Mōri est un détective privé, père de Ran et ex-mari du célèbre avocat Eri Kisaki. Il est accro au tabac, à l'alcool, aux courses de chevaux et aux concerts de Yoko Okino. Lorsque Conan rentre chez lui, sa renommée commence à grandir en tant que détective, ce qui lui vaut le surnom de détective endormi. Bien qu'il semble ne pas avoir d'intellect pour son travail de détective, il était autrefois un excellent policier. Il s’est parfois montré extrêmement intelligent, notamment dans les cas qui le concernaient directement, tels que ceux concernant ses amis du lycée, sa famille, etc. Cela nous montre qu'il ne fait pas vraiment de son mieux dans la plupart des cas.
Ran Mōri est une star de 17 ans dans l'histoire avec Shinichi. Elle est une amie d’enfance et est amoureuse de lui. Il accompagne généralement son père, Kogorō Mōri, et Conan dans les différents cas de meurtre, de suicide, de crime, etc. À plusieurs reprises, il a soupçonné que Conan était vraiment Shinichi, bien qu'il finisse toujours par se convaincre qu'il n'était qu'un enfant. Elle est capitaine de karaté dans son école secondaire et championne régionale. Il se révèle être une personne qui se soucie profondément de ceux qu'il aime, tout en étant patiente et gentille. Lorsqu'il s'aperçoit que le danger guette une personne dans son environnement, il agit de manière impulsive en essayant d'empêcher que ce danger n'endommage cette personne en question. Un exemple de ce qui précède est quand il sauve Ai Haibara de la fusillade de Calvados, un ancien membre de l'Organisation des hommes en noir. En dépit d'être une jeune femme intelligente et excessivement courageuse, elle craint profondément tout ce qui a trait au paranormal. Il est capable de reconnaître si Shinichi est proche de lui, sauf quand il ressemble à Conan, en raison de la coutume de sa compagnie, bien que parfois cette similitude des essences lui fasse douter de la véritable identité de l'enfant. Par le pouvoir précédent, Ran peut reconnaître les moments où Kaito Kid s'est déguisé en Shinichi, évitant ainsi d'être trompé par ce magicien.
Inventeur et voisin des Kudo. Hiroshi Agasa est un inventeur, il est conscient de la double identité du jeune homme et l’assiste dans la réalisation de gadgets utiles pour lui. Il habite dans sa maison, Ai Haibara, qui cherche un antidote à l'APTX4869. Hiroshi Agasa est un professeur de science qui est l'inventeur de nombreux gadgets utilisés par Conan pour résoudre les affaires.
Ai Haibara scientifique de l'Organisation des hommes en noir et créateur de APTX 4869, son vrai nom est Shiho Miyano et il a 18 ans. Dans l'organisation, ils la connaissaient sous le nom de Sherry. Après que Gin ait tué sa soeur Akemi Miyano, elle a décidé de prendre l'APTX 4869 en pensant qu'elle se tuerait, puisque l'organisation l'avait condamnée à ne plus travailler, cependant, elle a rétréci à la manière de Shinichi Kudo. Dans certaines parties de la série, on peut voir qu'Ai Haibara est attiré par Shinichi Kudo. Il vit avec le professeur Agasa et ils développent une relation assez particulière entre père et fille. Comme Conan, Haibara a une très bonne intuition et est souvent capable de "se présenter" quand quelqu'un la regarde, en particulier quand elle est quelqu'un de l'Organisation des hommes en noir.
Heiji Hattori est un jeune détective d'Osaka âgé de 17 ans. Dans sa ville, il a la même renommée que Shinichi à Tokyo, ce qui lui a valu le surnom de "grand détective de l'Ouest". Après quelques rencontres avec Conan, découvrez sa véritable identité. Au fil du temps, il devient un grand ami à lui. Il appartient au groupe des alliés de Conan. Son meilleur ami est Kazuha Tomaya, qu'elle connaît depuis son enfance et dont elle est amoureuse. Lorsque Kazuha est en danger ou lorsqu'un homme s'approche de lui considérablement, Hattori s'emporte rapidement, le poussant à agir impulsivement. À certaines occasions, il a laissé entendre à Kazuha qu'il avait des sentiments pour elle, mais il l'a immédiatement regretté. Il lui a donc raconté une série de choses qui réussissent à la confondre et à la convaincre qu'elle avait mal compris ses paroles. Hattori a de grandes capacités intellectuelles, de l'ingéniosité, en plus d'être un grand pratiquant de kendo. Il a aidé Conan dans diverses situations, afin de préserver sa véritable identité en tant que secret de Ran, de Kazuha et des hommes en noir.
Kazuha est l'amie d'enfance de Heiji Hattori et sa potentielle petite amie. Elle est douée en arts martiaux et est souvent impliquée dans les enquêtes de Heiji.
Masumi est une détective privée qui apparaît plus tard dans l'histoire. Elle est la sœur cadette de Shukichi Haneda et a un lien avec l'Organisation noire. Elle est très intelligente et aide souvent Conan à résoudre les affaires.
Shuichi est un agent du FBI qui travaille sous couverture et qui a un lien avec l'Organisation noire. Il est également le frère aîné d'Akemi Miyano, une ancienne membre de l'Organisation noire.
Jodie est un agent du FBI qui travaille sous couverture en tant que professeur d'anglais. Elle est également la petite amie de Shuichi Akai et est très proche de Haibara.
James est un agent du FBI qui travaille sous couverture en tant que professeur de sport. Il est également l'ami proche de Jodie Starling et est très compétent dans le combat à mains nues.
Vermouth est un membre de l'Organisation noire qui travaille sous couverture en tant qu'actrice. Elle est très intelligente et est connue pour changer d'apparence.
Gin est un membre de l'Organisation noire qui est très loyal à leur cause. Il est connu pour être impitoyable et cruel.
Vodka est un membre de l'Organisation noire qui travaille souvent avec Gin. Il est connu pour être moins cruel que Gin et pour être facilement manipulé par les autres membres de l'Organisation noire.
Rum est un membre de l'Organisation noire dont l'identité est inconnue. Il est considéré comme l'un des membres les plus importants de l'Organisation noire.
Eri est une célèbre avocate et la mère de Ran Mouri. Elle est également l'ex-femme de Kogoro Mouri, bien qu'elle ait toujours des sentiments pour lui.
Kaito Kid est un voleur renommé qui est également le fils du célèbre voleur Toichi Kuroba. Il est connu pour sa personnalité charismatique et son talent pour les tours de magie.
Saguru est un détective britannique qui apparaît plus tard dans l'histoire. Il est connu pour être très intelligent et pour avoir une grande admiration pour Sherlock Holmes.
Eisuke est un jeune homme riche qui apparaît plus tard dans l'histoire. Il est très intelligent et est amoureux de Ran Mouri.
Yusaku est le père de Shinichi Kudo et un célèbre auteur de romans policiers. Il est connu pour être très intelligent et pour avoir inspiré son fils à devenir détective.
Yukiko est la mère de Shinichi Kudo et une ancienne actrice. Elle est très intelligente et aide souvent son fils et ses amis à résoudre les affaires.
Tooru Amuro est un agent de la sécurité publique qui travaille sous couverture en tant que professeur de biologie. Il est également le fils de Mary Sera, un ancien membre de l'Organisation noire.
Mary est une ancienne membre de l'Organisation noire qui travaille maintenant pour la sécurité publique sous couverture en tant que Rena Mizunashi, une actrice célèbre. Elle est la mère de Masumi Sera et de Tooru Amuro.
Shukichi est un célèbre joueur de shogi et le frère aîné de Masumi Sera. Il est également un ami proche de Heiji Hattori.
Ranpo est un célèbre écrivain de romans policiers qui apparaît plus tard dans l'histoire. Il est connu pour être très intelligent et pour avoir inspiré Shinichi Kudo à devenir détective.
Masumi est la sœur cadette de Shukichi Haneda et une détective privée. Elle apparaît plus tard dans l'histoire et est très proche de Conan et de Haibara.
Hidemi Hondou est un agent de la CIA qui travaille sous couverture en tant que Kir, une journaliste de la police. Elle est également la sœur cadette de Rena Mizunashi, alias Mary Sera.
Andre Camel est un détective privé qui travaille souvent avec Kogoro Mouri. Il est connu pour être maladroit et pour se mettre souvent en danger.
Akemi est la sœur cadette de Shiho Miyano, alias Ai Haibara, et un ancien membre de l'Organisation noire. Elle est morte avant le début de l'histoire, mais son lien avec l'Organisation noire est important pour l'histoire.
Rumiko est la mère de Shuichi Akai et la veuve de Tsutomu Akai, un ancien agent du FBI. Elle a également un lien avec l'Organisation noire.
Shukuro est un enquêteur de police et l'ancien supérieur de Rei Furuya. Il a été impliqué dans une affaire de falsification de preuves et est en prison.
Rikumichi est un célèbre joueur de football et l'ancien petit ami de Hidemi Hondou. Il est impliqué dans une affaire de meurtre.
Rumi est une enseignante d'école primaire qui apparaît plus tard dans l'histoire. Elle est très mystérieuse et est liée à une ancienne affaire de meurtre.
Taka'aki Morofushi est le chef de l'Organisation noire. Son identité est inconnue et il est considéré comme l'un des ennemis les plus redoutables de Conan.
Mary Akai est la sœur aînée de Shuichi Akai et Tsutomu Akai. Elle est également un ancien membre de l'Organisation noire et est considérée comme morte.
Momiji est une jeune détective qui se présente comme la petite amie de Heiji Hattori. Elle est très perspicace et aide souvent à résoudre les affaires.
Tsutomu Akai est le mari de Rumiko Akai et un ancien agent du FBI. Il est mort dans une affaire liée à l'Organisation noire.
Hyoue Kuroda est un enquêteur de police très expérimenté qui est souvent appelé pour résoudre les affaires difficiles. Il est également un ancien collègue de Tooru Amuro.
Reiko Kujo est une célèbre actrice et la mère de Subaru Okiya. Elle est connue pour sa beauté et son talent d'actrice, ainsi que pour avoir inspiré de nombreux personnages dans les romans policiers de Yusaku Kudo.
Yui Uehara est une ancienne camarade de classe de Shinichi Kudo et Ran Mouri. Elle est maintenant une célèbre actrice et est impliquée dans une affaire de meurtre.