Shinichi est le protagoniste de l'histoire. Au début de l'histoire, il est infecté par un parasite, mais réussit à empêcher le parasite de prendre le contrôle de son cerveau. Il développe une relation de symbiose avec le parasite, qui prend le nom de Migi. Grâce à cette relation, Shinichi acquiert une force et une agilité surhumaines, ainsi qu'une capacité de régénération. Il utilise ces capacités pour combattre les autres parasites qui menacent la vie humaine.
Migi est un parasite qui infecte le bras droit de Shinichi. Contrairement aux autres parasites, Migi est incapable de prendre le contrôle du cerveau de son hôte. Il développe une relation de symbiose avec Shinichi, qu'il aide à combattre les autres parasites. Migi a une intelligence supérieure à celle des autres parasites et est capable d'apprendre à partir des expériences de Shinichi. Il est également immunisé contre les attaques de la plupart des autres parasites.
Satomi est une camarade de classe de Shinichi et son amour platonique. Elle est très attachée à Shinichi, mais ne connaît pas les vrais dangers auxquels il est confronté. Elle est souvent utilisée comme appât par les parasites pour attirer Shinichi dans des pièges.
Reiko est un parasite qui prend l'apparence d'une enseignante à l'école de Shinichi. Elle est très intelligente et manipulatrice, et a des motivations différentes des autres parasites. Elle cherche à établir une relation symbiotique entre les parasites et les humains, plutôt que de simplement les éliminer. Elle est finalement tuée par les humains après avoir donné naissance à l'enfant parasite qui deviendra plus tard Gotou.
Gotou est l'enfant parasite né de Reiko Tamura. Il est très puissant et est capable de se diviser en plusieurs formes pour attaquer ses ennemis. Il est également immunisé contre les attaques de Migi. Gotou est l'un des antagonistes les plus puissants de l'histoire, et Shinichi doit unir ses forces avec d'autres pour le vaincre.
Uragami est un psychopathe qui est obsédé par les parasites. Il les traque et les tue sans discrimination, sans se soucier des dommages collatéraux qu'il peut causer. Uragami est très dangereux pour les humains comme pour les parasites, et est considéré comme une menace par les deux camps.
Akiho est une camarade de classe de Shinichi qui est infectée par un parasite. Elle est tuée par Shinichi et Migi.
Kazuyuki est le père de Shinichi. Il est très distant avec son fils et se concentre principalement sur son travail en tant que journaliste. Il est finalement tué par des parasites.
Nobuko est la mère de Shinichi. Elle est très protectrice envers son fils et est prête à tout pour le protéger. Elle est finalement tuée par des parasites.
Kana est une camarade de classe de Shinichi qui développe des capacités psychiques après avoir été exposée à l'énergie des parasites. Elle est capable de détecter la présence des parasites et devient obsédée par la recherche de leur véritable nature. Elle est finalement tuée par un parasite.
Yuko est une présentatrice de télévision qui devient obsédée par les parasites et essaie de les traquer. Elle est finalement tuée par des parasites qui utilisent ses émissions de télévision pour les attirer.
Mamoru est un ami de Shinichi qui est tué par un parasite.
Kazumi est une amie de Satomi qui est amoureuse de Shinichi. Elle est finalement tuée par un parasite.
Kimihito est un parasite qui prend l'apparence d'un chien. Il est recueilli par Shinichi et Migi et devient leur allié. Kimihito est très loyal envers Shinichi et est prêt à le protéger à tout moment.
Kazuki est un ami de Shinichi qui est infecté par un parasite. Il est finalement tué par Shinichi et Migi.
Mitsuo est un camarade de classe de Shinichi qui est infecté par un parasite. Il est finalement tué par Shinichi et Migi.
Miki est un parasite qui s'infiltre dans la police en prenant l'apparence d'un inspecteur. Elle est finalement tuée par Shinichi et Migi.
Sato est un parasite qui prend l'apparence d'une femme. Elle est finalement tuée par Shinichi et Migi.
Arita est un parasite qui prend l'apparence d'un garde du corps. Il est finalement tué par Shinichi et Migi.
Le père de Kusano est un parasite qui prend l'apparence d'un homme d'affaires. Il est finalement tué par Shinichi et Migi.
Sasaki est un parasite qui prend l'apparence d'un policier. Il est finalement tué par Shinichi et Migi.
L'enfant de Reiko Tamura est un parasite qui devient plus tard Gotou. Il est très puissant et est considéré comme l'un des antagonistes les plus dangereux de l'histoire.
L'ami de Kuramori est un parasite qui s'infiltre dans la police en prenant l'apparence d'un inspecteur. Il est finalement tué par Shinichi et Migi.
Kuramori est un policier qui travaille avec Shinichi pour combattre les parasites. Il est finalement tué par Gotou.
Hikawa est un parasite qui prend l'apparence d'un chef d'entreprise. Il est finalement tué par Shinichi et Migi.
Mamoru Uda est un parasite qui prend l'apparence d'un chanteur populaire. Il est finalement tué par Shinichi et Migi.
Takeshi Hirokawa est un parasite qui prend l'apparence d'un écrivain célèbre. Il est très intelligent et manipulateur, et cherche à établir une société utopique pour les parasites. Il est finalement tué par Shinichi et Migi.
Le bébé de Miki est un parasite qui est tué par Shinichi et Migi.
Ryouko Tamiya est un parasite qui prend l'apparence d'une mère célibataire. Elle cherche à vivre en paix avec les humains et est en conflit avec les autres parasites qui cherchent à les éliminer. Elle est finalement tuée par les humains après avoir donné naissance à l'enfant parasite qui deviendra plus tard Gotou.
Shiro Kuramori est la fille de Kuramori. Elle est très intelligente et aide Shinichi et Migi à combattre les parasites en fournissant des informations sur leur comportement. Elle est finalement tuée par Gotou.
Les disciples de Takeshi Hirokawa sont des parasites qui le suivent dans sa quête pour établir une société utopique pour les parasites. Ils sont finalement tués par Shinichi et Migi.
L'hôte de Miki est un parasite qui s'infiltre dans la police en prenant l'apparence d'un inspecteur. Il est finalement tué par Shinichi et Migi.
L'hôte de Reiko Tamura est un parasite qui prend l'apparence d'un homme d'affaires. Il est finalement tué par Shinichi et Migi.
L'hôte de Mamoru Uda est un parasite qui prend l'apparence d'un garde du corps. Il est finalement tué par Shinichi et Migi.
L'hôte de Takeshi Hirokawa est un parasite qui prend l'apparence d'un écrivain célèbre. Il est finalement tué par Shinichi et Migi.
L'hôte de Mamoru Miyazono est un parasite qui s'infiltre dans la police en prenant l'apparence d'un inspecteur. Il est finalement tué par Shinichi et Migi.
La sœur de Nobuko est une femme qui est tuée par des parasites.
La grand-mère de Shinichi est une femme aimante qui est préoccupée par la sécurité de son petit-fils. Elle est très proche de Shinichi et l'aide à surmonter les traumatismes qu'il subit en combattant les parasites.
La progéniture de Migi est un groupe de parasites qui naissent après que Migi ait fusionné avec Shinichi. Ils sont moins intelligents que Migi mais sont toujours capables de communiquer avec lui.
La mère de Shiro est une femme qui est tuée par les parasites.
Yuuko Tachikawa est une présentatrice de télévision qui est tuée par un parasite.
Eiichi Shimizu est un professeur qui est tué par un parasite.
Shoichi Komiyama est un camarade de classe de Shinichi qui est tué par un parasite.
Le père de Shinichi est un homme travailleur qui est préoccupé par le bien-être de sa famille. Il soutient son fils dans sa lutte contre les parasites.
La mère de Shinichi est une femme aimante qui est préoccupée par la sécurité de son fils. Elle soutient Shinichi dans sa lutte contre les parasites.
Les victimes d'Uragami sont des humains et des parasites qu'il a tués.
La femme de l'hôte de Reiko Tamura est tuée par Reiko elle-même après qu'elle ait pris le contrôle de son corps.
Hideo Shimada est un camarade de classe de Shinichi qui est tué par un parasite.
Masanori est un parasite qui prend l'apparence d'un médecin. Il est finalement tué par Shinichi et Migi.
La victime de parasite est un homme qui est tué par un parasite.
La fille de l'hôte de Reiko Tamura est tuée par Reiko elle-même après qu'elle ait pris le contrôle de son corps.